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对于PCR实验室设计而言，必须掌握7条注意事项，主要体现在：主体结构、标准的三区分隔和气压调节、消毒、机械连锁不锈钢传递窗、地面、照明、样本处理区，下文对此会予以详细介绍。
1、主体结构
PCR实验室设计的主体材料为彩钢板、铝合金，为了解决积灰、积尘问题，实验室内的所有阴角、阳角都必须采用铝合金50内圆角铝。此外，设计方面还要做到线条简明、美观大方，同时兼顾结构牢固、密封性好。
2、标准的三区分隔和气压调节
所谓标准的三区分隔，就是指在PCR实验室设计时把其划分为试剂准备、标本制备、PCR扩增检测这3个独立区域。要有1条整体缓冲走廊来连接3个独立区域，且每个独立区域都有专门的缓冲区。
所谓气压调节，就是实验室内的空气气压的调节，这样可以避免实验中的样品污染，也能降低扩增产物对人员和环境的污染。那么，如何进行气压调节呢？可以打开缓冲区Ⅰ、Ⅱ和 PCR 扩增区的排风扇往外排气，并在实验区墙上和各扇门上都安装有风量可调的回风口。
3、消毒
在上文介绍的3个独立区域、缓冲区顶部与传送窗内部都必须安设用于消毒的紫外灯。此外，在试剂准备区、标本制备区还要安设移动紫外线灯，以便对实验桌进行局部消毒。
4、机械连锁不锈钢传递窗
不锈钢传递窗有机械连锁、电子连锁两种，建议在PCR实验室设计时采用前者。这样，能有效确保试剂和标本通过传递窗时不受污染。
5、地面
为了地面的整体性，以及耐腐蚀、易清洁，建议选择自流坪地坪或PVC地坪。如果预算有限，建议选择水磨石地坪或大块的瓷砖。
6、照明
PCR实验室内必须使用净化灯具，因为这类灯具不积尘、易清洁。安装净化灯具要注意2点，即：规范的安装流程和全面的服务流程、严格按照规范科学设计的安装流程。
7、样本处理区
PCR实验室的样本处理区要划分为4个部分，即：试剂配制区、样品处理区、核酸扩增区、产物分析区。如使用全自动分析仪，区域可适当合并。
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